El santuario de la naturaleza Laguna de Batuco tendrá como objetos de conservación los siguientes: los humedales con espejo de agua, los juncales y totorales, el matorral dominado por espino, la pradera húmeda salobre, la rana chilena, el piuquén y los sitios arqueológicos. El área posee las concentraciones más importantes de aves acuáticas en la zona central de nuestro país. Toda vez que, aproximadamente 144 especies de aves que han sido registradas en la Laguna de Batuco en los últimos 10 años, 66 especies corresponden a familias de aves acuáticas, de las cuales 47 se consideran especies regulares en el sitio y algunas se encuentran amenazadas y clasificadas en categorías de conservación.
