El sector de Bahía Chipana presenta una diversa variedad de especies de invertebrados, muchos de ellos favorecidos por la presencia de los macroalgas que les provee de forma esencial refugio y alimento (Villegas et al. 2008; Villegas et al. 2007; Humboldti Ltda. Investigación y Consultoría Ambiental). Bahía Chipana ha sido señalada frecuentemente como una de las áreas de mayor productividad biológica de la zona marina de la Primera Región y posee abundancia de recursos pelágicos de importancia comercial (Vargas & Sielfeld, 1997), como anchoveta y la sardina española, constituyendo una zona de reproducción de estas especies, ademas de una zona de reclutamiento y retención larval. Esta bahía registra la presencia de tortuga verde (Chelonia mydas), siendo esta bahía aparentemente el único lugar del litoral chileno donde se encontrarían todo el año. Chipana parece representar un corredor biológico para una serie de aves migratorias entre ellas playeros, chorlos, pitotoyes, rayadores, etc. De la misma forma es también un sitio importante para la tortuga marina negra (Chelonia agassizii) (CONAMA, 2005; Humboldti Ltda. Investigación y Consultoría Ambiental).
