La Laguna Lejía se ubica en la región de Antofagasta, en la comuna de San Pedro de Atacama, a una altura de 4.350 metros sobre el nivel del mar, en una zona del norte de Chile llamada la puna de Atacama. La puna se extiende como tejado andino a una altura entre 3.400 y 5.400 metros sobre el nivel del mar donde emergen volcanes y cerros como el volcán Láscar, el volcán Aguas Calientes, el Cordón Altos del Toro Blanco, el Volcán Chiliques y los cerros Lena y Tumisa que rodean a la laguna. Esta laguna tiene la particularidad de ser hipersalina con una pequeña superficie de 2 km2 y apenas un metro de profundidad, con temperatura promedio del agua de 1°C. El clima donde se sitúa la Laguna Lejía es árido con escasas precipitaciones, las que ocurren sólo en verano durante el fenómeno del invierno altiplánico, llegando sólo a los 200mm/año, por lo que aguas subterráneas que que se conectan entre los lagos de la zona mantienen a esta laguna. (Möller, P., 2008).
