El santuario de la naturaleza Lagos Huillinco y Cucao se encuentra integrada por tres unidades claramente identificables por sus características geográficas y hábitat para aves: (i) zona por que conecta el lago Cucao con el río y desemboca al mar, comprendiendo áreas limítrofes de dunas, playas y mallines, (ii) la ribera o margen ripariana de los lagos Huillinco y Cucao, y, (iii) los lagos Huillinco, Cucao y laguna Quilque. Los objetos de conservación de esta área son siguientes: el sistema hídrico, la zona ripariana, la flora acuática, el huillin, la avifauna, las formaciones vegetacionales terrestres, la flora y fauna en categoría de conservación.