El sitio prioritario Cordillera de la Costa se encuentra en la zona noroeste de la región de Los Lagos, limitando al norte con la región de Los Ríos, al sur abarca una pequeña zona de la comuna de Los Muermos (ya que incluye algunos aportantes del río Llico, límite natural entre las comunas de Fresia y Los Muermos), al oeste limita con el Oceáno Pacífico, y al este el límite esta dado por la geomorfología propia de la cordillera de la costa. El sitio prioritario atraviesa 5 comunas de la región de Los Lagos (de norte a sur): San Juan de la Costa, Río Negro, Purranque, Fresia y una pequeña porción de la comuna de Los Muermos (U.Chile, 2010).
Según Gastó (1993) el sitio presenta un clima de la provincia Húmeda de verano fresco. Esta provincia se caracteriza por presentar un clima templado frío lluvioso de costa occidental. Es un clima permanentemente húmedo y con posibilidades de precipitaciones anuales, fluctuantes desde más de 1.000 mm en Concepción, y sobrepasando los 2.400 mm.
El sitio presenta un relieve muy complejo, presentando muy pocas zonas de terrenos planos y abundando los terrenos en laderas y en lomajes. La cordillera es cruzada en diversos lugares por ríos a lo largo de su existencia, además presenta varios cauces que nacen en esta formación. En relación a la litología de la Cordillera de la Costa se conforma de rocas metamórficas y en su parte oriental de rocas sedimentarias (Mardones, 2005).